AnyDesk 提供了多種選項來在本地和遠端端點之間傳輸檔。這可以通過「檔管理員」會話或遠端控制會話中的「檔傳輸」來完成。
檔管理員
專用檔管理器功能目前在 Windows、 macOS 和 Linux 上可用。
它可以與互動式會話並行運行，也可以通過專用的檔管理員會話運行。
上傳： 將選定的檔案傳輸到相應的目錄中
下載： 從遠端設備檢索選定的檔
該設備： 當前目錄，始終顯示在左側
遠端設備： 合作設備的當前目錄，始終顯示在右側
目錄： “向上箭頭”和“雙點資料夾”（始終為標題）更改為“輸入遠端位址”欄位中的父目錄 
圖示。使用此模式，連接使用者將只能傳輸檔，而無法切換到遠端設備的圖形用戶介面。
或者，您只需右鍵按兩下「收藏夾」、「最近會話」、「發現」或「位址簿」中的磁貼，然後選擇「瀏覽檔」。
要在互動式遠端控制會話期間使用檔管理員，只需從 AnyDesk 工具列啟動它即可。
在此檢視中傳輸和編輯的檔案的歷史記錄可以在 「接受」視窗中找到。
檔傳輸
AnyDesk提供了在本地和遠端端點之間同步剪貼板的功能，這可以應用於文本和檔。
此功能是通過所有主要平臺提供的「複製和粘貼」功能提供的。目前有兩種支援使用 AnyDesk 執行此作的方法：
使用熱鍵 ─ 例如：
在遠端端點上選擇一個或多個檔，
使用快捷鍵 CTRL+C 複製檔，
在本地端點上打開資料夾，
使用快速鍵 CTRL+V 將檔案傳輸到本地端點。
使用內容選單 ─ 例如：
在本地端點上選擇一個或多個檔，
右鍵按下所選檔並選擇「複製」以複製檔，
在遠端端點上打開資料夾，
右鍵按單擊資料夾中的空白區域，然後選擇「粘貼」 以將檔案傳輸到本地端點。
禁用檔案傳輸
要關閉剪貼簿傳輸，請關閉：
“訪問我電腦的剪貼板”
和“訪問我電腦的剪貼板以傳輸檔”
在設置 > 安全 > 許可權 > 許可權配置檔 中要禁用它的配置檔。
第一個選項將禁用文本和檔的雙向剪貼板同步，而第二個選項將僅禁用使用剪貼板進行檔傳輸。
在遠端端點上，可以在「接受」視窗中臨時啟用或禁用檔案傳輸。
在本地端點上，可以在 AnyDesk 工具列的 許可權中 臨時啟用或禁用檔案傳輸。
使用 MacOS 進行檔案傳輸
將一個或多個檔複製到macOS端點時，遠端端端點上將顯示掛起的檔傳輸請求。要訪問傳輸的檔，請按兩下 AnyDesk 工具列中的紅色文件圖示或接受視窗中的橙色檔案傳輸圖示，將出現一個 macOS Finder 視窗，其中包含傳輸的檔。
使用 Linux 進行文件傳輸
檔傳輸到Linux設備具有不同的行為，具體取決於Linux設備是本地端點還是遠端端點。
本地端點
要將一個或多個檔案從遠端端點傳輸到基於 Linux 的本地端點，請執行以下作：
將要傳輸的檔案複製到遠端端端點。
預設檔案資源管理員會顯示在本地 Linux 端點上，包含傳輸的檔案 （） 。
遠端端點
要將一個或多個檔從本地端點傳輸到基於 Linux 的遠端端點，請執行以下作：
將要傳輸的檔案複製到本地端點。
在遠端 Linux 端點中打開“接受”視窗，轉到“檔案傳輸”選項卡，然後按兩下“接受檔”。
預設的檔案資源管理員視窗將顯示在帶有傳輸檔的遠端 Linux 端點上。
使用 Android 傳輸檔
- 會話功能表 >作 > 將檔案傳輸到遠端設備
- 選擇要傳輸的檔
- 在基於遠端桌面的平臺上，打開文件資源管理員並導航到所需的傳輸位置
- 右鍵按下傳輸位置區域並選擇“粘貼”
將檔案從基於遠端桌面的平台傳輸到 Android 裝置：
- 在基於遠端桌面的平臺上，使用上下文功能表或快捷方式將要傳輸的檔案複製到 Android 設備
- 會話功能表>作 > 從遠端設備下載檔
在適用於Android的AnyDesk 7.0.0中，引入了檔管理器功能，使用戶能夠創建檔傳輸會話。要啟動檔傳輸會話，只需在「遠端位址」欄位中輸入 AnyDesk 位址，點擊三點功能表，然後選擇「瀏覽檔」。。
與桌面平台類似，此功能允許您在本地 Android 設備和遠端端點之間傳輸和管理檔和資料夾。
對於 AnyDesk 5.1.0 及更高版本，可以在 iOS 和非 iOS 作系統之間傳輸檔。
目前無法在 tvOS 裝置之間傳輸檔。
將檔案從 iOS 裝置傳輸到非 iOS 裝置：
- 在 Apple File 應用程式中對要傳輸的檔案使用「共用」作，選擇“更多”，然後選擇“AnyDesk”。
- 從 AnyDesk 5.2.0 開始，Apple Photos 應用程式中也提供了此共用到 AnyDesk 功能。
- AnyDesk 將自動打開，您可以在其中輸入或選擇要將檔案傳輸到的 AnyDesk-ID。
- 遠端電腦接受 AnyDesk 連接後，您可以導航到所需的儲存位置並點擊底部的紅色條來傳輸檔。
從非 iOS 裝置檢索檔：
- 在 iOS 裝置上輸入您要從中檢索文件的設備的 AnyDesk-ID/別名
- 按住「連接」按鈕，將出現一條提示，詢問您是否要定期「連接」或啟動檔傳輸會話。
- 遠端設備接受連接后，iOS 設備將傳輸到檔案資源管理器檢視。
- 選擇您要檢索的檔，然後點擊螢幕底部的紅色下載按鈕。
- 選擇下載的檔應在 iOS 裝置上保存的位置。